PROLOGO: Jason Bourne (Matt Damon) letale macchina per uccidere al servizio della CIA perde la memoria ritrovandosi in fin di vita ripescato al largo delle coste italiane, guadagnata la terraferma cercherà di ricostruire frammento dopo frammento la sua identità, cercando nel frattempo di sfuggire ad alcuni killer che gli danno la caccia e innamorandosi della bella Marie (Franka Potente) che gli rimarrà al fianco.
IERI: Sfuggito ad una poderosa caccia all’uomo organizzata dalla CIA e rifugiatosi in India, Bourne vedrà morire la sua donna a causa di un killer della mafia russa, e in cerca di vendetta sventerà un complotto ordito ai suoi danni dall’Agenzia onde trasformarlo nel perfetto capro espiatorio.
OGGI: mentre Bourne prosegue la sua ricerca per scoprire chi materialmente ne ha fatto uno spietato killer e chi ha ucciso la sua Marie, la CIA mette in cantiere un nuovo progetto segretissimo a base di super-killer. e mentre la caccia porterà Bourne da New York a Tangeri passando per Torino, Londra e Madrid, l’identità del suo creatore si farà sempre più vicina.