Cineasta tedesco nato e cresciuto a Berlino, esperto di effetti visivi, l’esordio è come sceneggiatore e regista del cortometraggio animato Mind the gap (1994), nel 1996 un altro corto, Monkey business.
nel 1998 il regista dirige il cortometraggio animato the tenor, Nel 1999 partecipa alla realizzazione del film per ragazzi Stuart Little nella squadra di sviluppo degli effetti visivi, e nel 2002 lavora anche al sequel, Stuart Little 2.
Nel 2003 la Disney decide di trasformare un’attrazione del parco Disneyland in un film, La casa dei fantasmi, protagonista l’attore Eddie Murphy, Freudenthal si occuperà della seconda unità di questa produzione diretta da Rob Minkoff.
Dal 20 febbraio 2009 nelle sale italiane l’ultima fatica del regista, la comedy per famiglie Hotel Bau, alcuni ragazzi allestiscono un hotel abbandonato per accogliere dei cani randagi, ma la cosa gli sfuggirà presto di mano, tra gli interpreti Emma Roberts la nipote di Julia Roberts e Don Cheadle.